fix: 修复35个安全与功能缺陷，补全知识进化/数字孪生/行为采集模块

## 安全修复 (12项)
- Webhook接口添加全局Token认证，过滤敏感请求头
- 修复JWT Base64 padding公式，防止签名验证绕过
- 数据库密码/飞书Token从源码移除，改为环境变量
- 工作流引擎添加路径遍历防护 (_resolve_safe_path)
- eval()添加模板长度上限检查
- 审批API添加认证依赖
- 前端v-html增强XSS转义，console.log仅开发模式输出
- 500错误不再暴露内部异常详情

## Agent运行时修复 (7项)
- 删除_inject_knowledge_context中未定义db变量的finally块
- 工具执行添加try/except保护，异常不崩溃Agent
- LLM重试计入budget计数器
- self_review异常时passed=False
- max_iterations截断标记success=False
- 工具参数JSON解析失败时记录警告日志
- run()开始时重置_llm_invocations计数器

## 配置与基础设施
- DEBUG默认False，SQL_ECHO独立配置项
- init_db()补全13个缺失模型导入
- 新增WEBHOOK_AUTH_TOKEN/SQL_ECHO配置项
- 新增.env.example模板文件

## 前端修复 (12项)
- 登录改用URLSearchParams替代FormData
- 401拦截器通过Pinia store统一清理状态
- SSE流超时从60s延长至300s
- final/error事件时清除streamTimeout
- localStorage聊天记录添加24h TTL
- safeParseArgCount替代模板中裸JSON.parse
- fetchUser 401时同时清除user对象

## 新增模块
- 知识进化: knowledge_extractor/retriever/tasks
- 数字孪生: shadow_executor/comparison模型
- 行为采集: behavior_middleware/collector/fingerprint_engine
- 代码审查: code_review_agent/document_review_agent
- 反馈学习: feedback_learner
- 瓶颈检测/优化引擎/成本估算/需求估算
- 速率限制器 (rate_limiter)
- Alembic迁移 015-020

## 文档
- 商业化落地计划
- 8篇docs文档 (架构/API/部署/开发/贡献等)
- Docker Compose生产配置

Co-Authored-By: Claude Opus 4.6 <noreply@anthropic.com>

backend/app/core/tools_bootstrap.py

@@ -8,7 +8,7 @@ logger = logging.getLogger(__name__)
 
 _registered = False
 
-_EXPECTED_BUILTIN = 54
+_EXPECTED_BUILTIN = 56
 
 
 def ensure_builtin_tools_registered() -> None:
@@ -72,6 +72,8 @@ def ensure_builtin_tools_registered() -> None:
         feishu_read_messages_tool,
         feishu_create_sheet_tool,
         feishu_upload_file_tool,
+        create_gitea_issue,
+        parse_test_result_file,
         HTTP_REQUEST_SCHEMA,
         FILE_READ_SCHEMA,
         FILE_WRITE_SCHEMA,
@@ -126,6 +128,8 @@ def ensure_builtin_tools_registered() -> None:
         FEISHU_READ_MESSAGES_SCHEMA,
         FEISHU_CREATE_SHEET_SCHEMA,
         FEISHU_UPLOAD_FILE_SCHEMA,
+        CREATE_GITEA_ISSUE_SCHEMA,
+        PARSE_TEST_RESULT_FILE_SCHEMA,
     )
 
     tool_registry.register_builtin_tool("http_request", http_request_tool, HTTP_REQUEST_SCHEMA)
@@ -182,6 +186,8 @@ def ensure_builtin_tools_registered() -> None:
     tool_registry.register_builtin_tool("feishu_read_messages", feishu_read_messages_tool, FEISHU_READ_MESSAGES_SCHEMA)
     tool_registry.register_builtin_tool("feishu_create_sheet", feishu_create_sheet_tool, FEISHU_CREATE_SHEET_SCHEMA)
     tool_registry.register_builtin_tool("feishu_upload_file", feishu_upload_file_tool, FEISHU_UPLOAD_FILE_SCHEMA)
+    tool_registry.register_builtin_tool("create_gitea_issue", create_gitea_issue, CREATE_GITEA_ISSUE_SCHEMA)
+    tool_registry.register_builtin_tool("parse_test_result_file", parse_test_result_file, PARSE_TEST_RESULT_FILE_SCHEMA)
     _registered = True
 
     n = tool_registry.builtin_tool_count()