feat: Agent 运行时、对话 API、作业助手与引擎修复及前端执行超时

- agent_runtime 模块与 agent_chat API，前端 AgentChat 视图与路由对接
- workflow_engine: code 节点命名空间与 json 引用修复
- llm_service: 工具调用 extra_body（如 DeepSeek）
- create_homework_manager_agent / _3 脚本与测试脚本扩展
- frontend: WORKFLOW_EXECUTION_HTTP_TIMEOUT_MS、AgentChatPreview/MainLayout 等
- 文档：架构说明与自主 Agent 改造完成情况

Made-with: Cursor

frontend/src/api/index.ts

@@ -39,6 +39,9 @@ const getApiBaseURL = () => {
   return 'http://localhost:8037'
 }
 
+/** Agent/Celery + LLM 等长耗时接口的单次 HTTP 超时（与 run_agent_test_cases 默认 max_wait 300s 量级一致） */
+export const WORKFLOW_EXECUTION_HTTP_TIMEOUT_MS = 300000
+
 const api = axios.create({
   baseURL: getApiBaseURL(),
   timeout: 30000